Tin sinh học luôn sử dụng các chương trình máy tính để xác định chức năng của gen và protein và thiết lập các mối quan hệ tiến hóa. Ngôn ngữ lập trình rất hữu ích trong tin sinh học vì nhiều lý do. Nếu bạn muốn nổi bật với tư cách là một chuyên gia tin sinh học, thì việc có kiến thức và kỹ năng lập trình bằng Python có thể rất có lợi
Trong bài viết này, bạn sẽ tìm hiểu về lợi ích của việc sử dụng Python trong tin sinh học, các lộ trình giáo dục có sẵn và thư viện tin sinh học Python. Ngoài ra còn có một hướng dẫn học tập từng bước để giúp bạn bắt đầu. Bạn sẽ có được tất cả thông tin cần thiết để trở thành một chuyên gia khi nói đến Python và tin sinh học
Tìm trận đấu Bootcamp của bạn
- Career Karma kết hợp bạn với các bootcamp công nghệ hàng đầu
- Truy cập học bổng độc quyền và các khóa học chuẩn bị
Tên
Họ
Điện thoại .
By continuing you agree to our Terms of Service and Privacy Policy, and you consent to receive offers and opportunities from Career Karma by telephone, text message, and email.
Trăn là gì?
Python là ngôn ngữ lập trình đa năng được sử dụng để phát triển trang web và phần mềm, tự động hóa và phân tích dữ liệu. Đây là một trong những ngôn ngữ lập trình phổ biến nhất trên thế giới do thiết kế cấp cao, dễ tiếp cận và dễ hiểu, phù hợp với nhiều dự án.
Python đã được sử dụng để viết một số ứng dụng phần mềm phổ biến như YouTube, Google, Instagram, Spotify, Reddit và Quora. Nó được các lập trình viên ưa thích vì nó trực quan hơn các ngôn ngữ lập trình khác. Nó cũng là một trong những công cụ phổ biến được sử dụng trong tin sinh học vì nó nhấn mạnh vào khả năng đọc mã
Python được sử dụng để làm gì trong tin sinh học?
Python được sử dụng cho một số nhiệm vụ trong tin sinh học bao gồm nghiên cứu học thuật, thao tác dữ liệu, giải trình tự protein, phân tích dữ liệu, trực quan hóa dữ liệu, truy cập cơ sở dữ liệu và học thống kê. Nó cũng được sử dụng để phân tích cấu trúc đại phân tử, phân tích trình tự DNA và phân tích dữ liệu microarray.
Hầu hết các chuyên gia tin sinh học hoặc nhà sinh học không biết cách lập trình và thích dành thời gian cho các nhiệm vụ khác. Điều này làm cho Python trở nên lý tưởng đối với họ vì có rất nhiều thư viện giúp hợp lý hóa quy trình lập trình. Các chuyên gia này cũng thấy nó hữu ích để tạo nguyên mẫu nhanh hơn, gỡ lỗi dễ dàng hơn và mang lại kết quả tốt hơn
Sẽ mất bao lâu để học Python cho tin sinh học?
Sẽ mất từ vài tuần đến vài tháng. Điều này phụ thuộc vào con đường giáo dục, hình thức học tập và kiến thức hoặc kinh nghiệm lập trình trước đây của bạn. Có nhiều con đường giáo dục khác nhau để bạn học Python, chẳng hạn như bootcamp mã hóa hoặc lớp học trực tuyến.
Bootcamp mã hóa thường mất từ bốn tuần đến chín tháng tùy thuộc vào lựa chọn bootcamp và hình thức học tập của bạn. Các chương trình bán thời gian và trực tuyến thường kéo dài hơn các chương trình toàn thời gian và trực tiếp. Các khóa học trực tuyến chủ yếu là tự học và phụ thuộc hoàn toàn vào bạn
Tại sao bạn nên học Python cho tin sinh học?
Python là ngôn ngữ lập trình ưa thích cho tin sinh học vì nhiều lý do. Phần này sẽ trình bày chi tiết ngắn gọn về một số lý do bao gồm thiết kế dễ sử dụng, cộng đồng và thư viện rộng lớn, tính nhất quán và độ tin cậy, thao tác dữ liệu dễ dàng và khả năng tương thích với các công cụ hiện có
Dễ sử dụng
Python được thiết kế cho người mới bắt đầu để có thể tận dụng các lợi ích của nó với sự trợ giúp của nhiều thư viện có sẵn miễn phí. Nó có một cú pháp tương tự như ngôn ngữ tiếng Anh giúp bạn dễ dàng tìm đường lập trình và phát triển web hoặc phần mềm.
» THÊM. Cách sao chép danh sách bằng Python
Là một chuyên gia tin sinh học, bạn sẽ phải tập trung vào các nhiệm vụ khác và cần một ngôn ngữ lập trình dễ sử dụng mà bạn không mất quá nhiều thời gian để thành thạo
Cộng đồng lớn
Python là một ngôn ngữ rất phổ biến với một cộng đồng lớn dẫn đến việc tạo ra một số thư viện để hỗ trợ lĩnh vực tin sinh học. Cộng đồng Python bao gồm hàng triệu nhà phát triển phần mềm sẵn sàng giúp đỡ bạn.
Một số cộng đồng Python phổ biến nhất bao gồm Full Stack Python, PySlackers, Real Python và Python Discord. Là một người sẵn sàng học và sử dụng Python, việc tham gia bất kỳ cộng đồng nào trong số này sẽ rất hữu ích vì bạn có thể dễ dàng liên hệ với bất kỳ chuyên gia nào có sẵn để được trợ giúp.
Đa năng, đáng tin cậy và hiệu quả
Python có thể hoạt động hiệu quả trong nhiều môi trường. Cho dù bạn đang làm việc với ứng dụng web hay máy tính để bàn, bạn có thể mong đợi kết quả giống nhau. Đây là một trong những lý do tại sao Python rất phổ biến đối với các lập trình viên. Nó cũng nhanh hơn nhiều ngôn ngữ lập trình khác
Thao tác và trực quan hóa dữ liệu dễ dàng
Là một chuyên gia tin sinh học, bạn sẽ thường xuyên làm việc với thao tác dữ liệu. Pandas, một thư viện nguồn mở trong Python, cho phép phân tích dữ liệu và cấu trúc dữ liệu hiệu suất cao, dễ dàng, cần thiết cho thao tác dữ liệu.
Python cũng tốt cho việc trực quan hóa dữ liệu vì nó là mã nguồn mở, dễ truy cập và có một thư viện cho nhiều tác vụ. Nhiều thư viện trực quan hóa dữ liệu Python có thể được sử dụng để tạo các biểu đồ trực tiếp, được cá nhân hóa và các bản trình bày tương tác
Khả năng tương thích với các công cụ hiện có
Một trong những điều tốt nhất về Python là khả năng tích hợp với các công nghệ hiện có. Khi thực hiện một tác vụ với Python, API REST có thể giúp bạn tích hợp. Python cũng có thể chạy trên hầu hết các nền tảng
Làm cách nào tôi có thể học Python cho tin sinh học?
Bạn có thể chọn các lộ trình giáo dục khác nhau để học Python cho tin sinh học. Bạn có thể tham gia một bootcamp mã hóa, đăng ký một khóa học trực tuyến hoặc đọc và thực hành với sách giáo khoa Python. Mỗi người đều có lợi thế của mình và quyết định phụ thuộc vào điều gì phù hợp với mục tiêu và con đường sự nghiệp của bạn
Bootcamp mã hóa
Bootcamp mã hóa được thiết kế để trang bị cho sinh viên những kỹ năng liên quan cần thiết để bắt đầu sự nghiệp trong lĩnh vực công nghệ. Họ thường cung cấp các chương trình trong các lĩnh vực công nghệ khác nhau, từ các ngôn ngữ lập trình cụ thể như Python đến các chuyên ngành công nghệ như khoa học dữ liệu.
Chúng ngắn hạn và hấp dẫn và có thể dạy cho bạn những kỹ năng cần thiết trong vài tuần hoặc vài tháng tùy thuộc vào hình thức học tập và lựa chọn bootcamp của bạn. Thinkful là một bootcamp mã hóa hàng đầu cung cấp nhiều chương trình bao gồm chương trình khoa học dữ liệu dạy Python trong chương trình giảng dạy của nó. Nó cung cấp một lịch trình trực tuyến bán thời gian kéo dài trong sáu tháng
» THÊM. Yêu cầu Python. Hướng dẫn
Các khóa học trực tuyến
Các khóa học trực tuyến là một cách tốt để trở thành một lập trình viên tự học. Có một số nền tảng học tập trực tuyến mà bạn có thể sử dụng để tạo lợi thế cho mình ngay hôm nay và đạt được các kỹ năng cần thiết trong thời gian của riêng bạn. Điều tuyệt vời về các chương trình trực tuyến là chúng thường có nhịp độ riêng và cũng có thể cung cấp đào tạo thực hành
Đối với những người có ngân sách tiết kiệm, bạn cũng có thể tìm thấy một số khóa học miễn phí cung cấp chương trình giảng dạy giống như các khóa học trả phí. Một ví dụ về điều này là Lập trình Đáp ứng Sinh học của Coursera. Tin sinh học cho người mới bắt đầu cho phép bạn đăng ký miễn phí và cũng nhận được chứng chỉ có thể chia sẻ khi kết thúc chương trình
Sách
Mặc dù bạn có thể tìm hiểu tất cả các chi tiết và các bước cần thiết thông qua sách, nhưng điều đó có thể là không đủ. Tuy nhiên, nó có thể giúp bạn bắt đầu trong lĩnh vực này nếu bạn tham gia vào các dự án thực hành thường xuyên để thực hành các kỹ năng bạn học được.
Có một số cuốn sách dành cho những ai muốn tìm hiểu hoặc nâng cao kiến thức về Python cho tin sinh học. Một số trong số chúng bao gồm Python cho tin sinh học của Sebastian Bassi, Lập trình tin sinh học bằng Python của Mitchell L. Mô hình và Làm chủ Python cho Tin sinh học của Ken Youens-Clark
Python hàng đầu cho thư viện tin sinh học
Python có các thư viện rộng lớn mà bạn sẽ thấy hữu ích khi là người mới bắt đầu và chuyên gia trong lĩnh vực này. Đối với bất kỳ tác vụ nào bạn có thể muốn thực hiện bằng Python, bạn gần như có thể được đảm bảo tìm được thư viện cho nó. Dưới đây là một số thư viện Python cho tin sinh học.
- BioPython. BioPython là một công cụ mã nguồn mở trong Python được tạo bởi liên minh các nhà phát triển quốc tế. Nó là một tập hợp các công cụ Python được sử dụng cho sinh học tính toán và tin sinh học. Đây là một thư viện lý tưởng để sử dụng khi học Python cho tin sinh học và tài liệu tính năng, căn chỉnh trình tự và mã nguồn
- PyCogent. PyCogent là một thư viện phần mềm dành cho sinh học bộ gen được sử dụng để hiểu các trình tự sinh học và bộ gen
- Biskit. Biskit là một thư viện Python mã nguồn mở khác có thể được sử dụng để nghiên cứu, thao tác và phân tích tin sinh học cấu trúc về cấu trúc đại phân tử, phức hợp protein và quỹ đạo động lực phân tử.
- ngân hà. Galaxy là một nền tảng mở, dựa trên web dành cho nghiên cứu y sinh chuyên sâu về dữ liệu với cộng đồng các chuyên gia muốn chia sẻ những phát hiện của họ. Dễ sử dụng, tái sản xuất và minh bạch
- PyMOL. PyMOL là phần mềm hiển thị phân tử mã nguồn mở có thể được sử dụng để hiển thị và tạo hoạt ảnh cho các cấu trúc phân tử 3D
Cách học Python cho tin sinh học. Hướng dẫn từng bước
Có nhiều bước khác nhau mà bạn có thể thực hiện để học Python cho tin sinh học tùy thuộc vào những gì phù hợp với bạn. Hướng dẫn từng bước sau đây được khuyến nghị để giúp hành trình học tập của bạn dễ dàng hơn và cũng giúp bạn trở thành một chuyên gia.
» THÊM. Đối số vị trí Python theo sau đối số từ khóa Giải pháp
Hoàn thiện kỹ năng toán học của bạn
Để bắt đầu học Python như một công cụ tin sinh học, bạn cần đảm bảo rằng bạn biết các khía cạnh quan trọng của toán học bao gồm đại số, giải tích, xác suất và thống kê. Những kỹ năng này rất cần thiết để giúp bạn hiểu những điều cơ bản về Python và lập trình nói chung. Bạn có thể làm điều này bằng cách tham gia một số khóa học trực tuyến, đọc sách liên quan và thực hành
"Career Karma bước vào cuộc đời tôi khi tôi cần nó nhất và nhanh chóng giúp tôi phù hợp với bootcamp. Hai tháng sau khi tốt nghiệp, tôi đã tìm được công việc mơ ước phù hợp với giá trị và mục tiêu của mình trong cuộc sống. "
Venus, Kỹ sư phần mềm tại Rockbot
Find Your Bootcamp MatchTìm hiểu thuật toán và cấu trúc dữ liệu
Cấu trúc dữ liệu cho phép bạn lưu trữ và truy cập dữ liệu và hiểu rõ về chúng sẽ giúp ích cho bạn khi làm việc với Python. Python được thiết kế để người dùng có thể xây dựng cấu trúc dữ liệu của riêng mình và kiểm soát chức năng của chúng. Các thuật toán được sử dụng để cung cấp giải pháp cho các vấn đề phân tích dữ liệu mà bạn có thể gặp phải khi làm việc
Học cách viết mã với Python
Khi bạn đã hiểu về cấu trúc dữ liệu và thuật toán, bạn có thể tham gia bất kỳ khóa học nào trong số nhiều khóa học có sẵn trên Internet để học cách viết mã bằng Python. Học Python có thể dễ dàng vì cú pháp của nó tương tự như ngôn ngữ tiếng Anh và thân thiện với người mới bắt đầu. Nếu gặp bất kỳ khó khăn nào, bạn có thể tìm kiếm sự trợ giúp từ cộng đồng và thư viện lớn của Python
Tìm hiểu tin sinh học
Điều này dành cho những người chưa phải là chuyên gia về tin sinh học. Những người có thể dễ dàng chuyển sang giai đoạn tiếp theo và bắt đầu thực hiện các dự án. Đối với những người không, bạn nên thu thập càng nhiều tài nguyên càng tốt và sử dụng các tài nguyên trực tuyến để hiểu sâu hơn về tin sinh học. Điều này sẽ dễ dàng, đặc biệt đối với những người đã có kinh nghiệm sinh học
Làm việc trên các dự án tin sinh học Python
Giai đoạn cuối cùng liên quan đến việc bạn thực hiện càng nhiều dự án càng tốt, bắt đầu với những dự án dễ dàng. Bạn có thể kiểm tra trực tuyến các dự án tin sinh học Python cho người mới bắt đầu và cố gắng làm việc với một mã mỗi ngày để hoàn thiện chúng. Khi bạn đã hoàn thành một số dự án cấp độ mới bắt đầu và tự tin vào kỹ năng của mình, bạn có thể chuyển sang cấp độ tiếp theo và đăng ký các vai trò cấp độ đầu vào.
Bắt đầu học Python cho tin sinh học ngay hôm nay
Theo Cục Thống kê Lao động, các nhà khoa học nghiên cứu máy tính và thông tin, bao gồm các chuyên gia tin sinh học, có triển vọng việc làm là 22%. Tỷ lệ này cao hơn hầu hết các ngành nghề khác. Các nhà khoa học tin sinh học có mức lương trung bình hàng năm là 96.979 đô la theo PayScale, cũng cao hơn hầu hết các ngành nghề
Học Python cho tin sinh học sẽ giúp bạn nâng cao triển vọng nghề nghiệp trong ngành. Cho dù bạn là người mới làm quen với tin sinh học hay một chuyên gia dày dạn kinh nghiệm, việc có kỹ năng Python sẽ giúp bạn tăng triển vọng nghề nghiệp
1 Xếp hạng
Về chúng tôi. Career Karma là một nền tảng được thiết kế để giúp người tìm việc tìm kiếm, nghiên cứu và kết nối với các chương trình đào tạo việc làm để thăng tiến trong sự nghiệp của họ. Tìm hiểu về ấn phẩm CK